LSF HPC Suite v10.2를 CentOS 7.6 (ppc64le, IBM POWER8) 환경에서 설치하는 과정을 정리했습니다.
먼저 LSF 설치에 필요한 사전 준비를 합니다. Password를 넣지 않고 ssh가 되도록 하는 것이 관건입니다. 저는 일단 root user로도 ssh가 가능하도록 아래와 같이 설정했습니다. 여기서는 p628-kvm1~3 총 3대의 가상서버가 있습니다.
[cecuser@p628-kvm1 ~]$ sudo yum install -y openssh-clients
[cecuser@p628-kvm1 ~]$ ssh-keygen
[cecuser@p628-kvm1 ~]$ ssh-copy-id p628-kvm1
[cecuser@p628-kvm1 ~]$ ssh-copy-id p628-kvm2
[cecuser@p628-kvm1 ~]$ ssh-copy-id p628-kvm3
[cecuser@p628-kvm1 ~]$ sudo vi /etc/ssh/sshd_config
#PermitRootLogin yes
PermitRootLogin yes
[cecuser@p628-kvm1 ~]$ sudo systemctl restart sshd
[cecuser@p628-kvm1 ~]$ su -
Password:
-bash-4.2# ssh-keygen
-bash-4.2# ssh-copy-id p628-kvm1
-bash-4.2# ssh-copy-id p628-kvm2
-bash-4.2# ssh-copy-id p628-kvm3
이제 LSF HPC Suite의 installation bin file을 수행합니다. 이 파일이 수행하는 것은 LSF를 설치하는 것이 아니라, 그 설치를 위한 ansible 기반의 installer를 설치 및 구성하는 것입니다.
[cecuser@p628-kvm1 ~]$ sudo ./lsfshpc10.2.0.9-ppc64le.bin
Installing LSF Suite for HPC 10.2.0.9 deployer ...
Checking prerequisites ...
httpd is not installed.
Installing httpd ...
createrepo is not installed.
Installing createrepo ...
Installed Packages
rsync.ppc64le 3.1.2-6.el7_6.1 @updates
Installed Packages
curl.ppc64le 7.29.0-51.el7 @base
Installed Packages
python-jinja2.noarch 2.7.2-3.el7_6 @updates
Installed Packages
yum-utils.noarch 1.1.31-50.el7 @base
httpd is not running. Trying to start httpd ...
Copying LSF Suite for HPC 10.2.0.9 deployer files ...
Installing Ansible ...
Spawning worker 0 with 1 pkgs
,,,,
Gathering deployer information ...
Creating LSF Suite repository ...
LSF Suite for HPC 10.2.0.9 deployer installed
To deploy LSF Suite to a cluster:
- Change directory to "/opt/ibm/lsf_installer/playbook"
- Edit the "lsf-inventory" file with lists of machines and their roles in the cluster
- Edit the "lsf-config.yml" file with required parameters
- Run "ansible-playbook -i lsf-inventory lsf-deploy.yml"
Installing ibm-jre ...
Connecting to IBM Support: Fix Central to query the latest fix pack level ...
This is the latest available fix pack.
이제 아래와 같이 lsf-inventory 파일 속의 hostname 등을 등록합니다. 여기서는 p628-kvm1 p628-kvm2 p628-kvm3의 총 3대 중에서, p628-kvm1이 master 역할을 함과 동시에 compute host 역할까지 하는 것으로 설정했습니다. p628-kvm1에서는 연산작업을 하지 않고 master 역할만 하기를 원한다면 [LSF_Servers]에서는 p628-kvm1이 빠져야 합니다.
[cecuser@p628-kvm1 ~]$ cd /opt/ibm/lsf_installer/playbook
[cecuser@p628-kvm1 playbook]$ sudo vi lsf-inventory
[LSF_Masters]
p628-kvm1
[LSF_Servers]
p628-kvm[1:3] # p628-kvm1 p628-kvm2 p628-kvm3을 쉽게 표현한 것입니다
같은 directory의 lsf-config.yml도 필요시 수정합니다만, 여기서는 일단 하지 않겠습니다.
[cecuser@p628-kvm1 playbook]$ sudo vi lsf-config.yml
(필요시)
my_cluster_name: myCluster # 이것이 default cluster name입니다. 여기서는 굳이 cluster 이름을 수정하지 않았습니다.
HA_shared_dir: none # High-Availability를 위한 directory로서, 설정하면 여기에 configuration file들과 work directory가 copy됩니다.
NFS_install_dir: none # 여기에 NFS mount point를 등록하면 그 directory에 LSF master, server & client binary file들과 config file들이 설치되어 cluster 내에서 공유됩니다
수정이 끝났으면 다음과 같이 문법에 오류가 없는지 테스트를 해봅니다.
[cecuser@p628-kvm1 playbook]$ sudo ansible-playbook -i lsf-inventory lsf-config-test.yml
...
TASK [Check if Private_IPv4_Range is valid] ************************************
TASK [Check if Private_IPv4_Range IP address is available] *********************
PLAY RECAP *********************************************************************
localhost : ok=0 changed=0 unreachable=0 failed=0
p628-kvm1 : ok=16 changed=0 unreachable=0 failed=0
p628-kvm2 : ok=11 changed=0 unreachable=0 failed=0
p628-kvm3 : ok=11 changed=0 unreachable=0 failed=0
원래 manual에는 아래와 같이 lsf-predeploy-test.yml를 이용해서 추가 검증 테스트를 해보라고 되어 있는데, 해보면 아래와 같이 remote 서버 2대에서만 엉뚱한 error가 납니다. 아무리 이것저것 해봐도 계속 같은 오류가 나던데, 그냥 무시하셔도 될 것 같습니다. 저는 무시하고 그냥 진행했는데, 결과적으로는 문제가 없었습니다.
[cecuser@p628-kvm1 playbook]$ sudo ansible-playbook -i lsf-inventory lsf-predeploy-test.yml
...
TASK [debug deployer] **********************************************************
fatal: [p628-kvm2]: FAILED! => {"failed": true, "msg": "The conditional check 'LSF.Private_IPv4_Range is defined and LSF.Private_IPv4_Range != 'none' and LSF.Private_IPv4_Range is not none' failed. The error was: error while evaluating conditional (LSF.Private_IPv4_Range is defined and LSF.Private_IPv4_Range != 'none' and LSF.Private_IPv4_Range is not none): 'LSF' is undefined\n\nThe error appears to have been in '/opt/ibm/lsf_installer/playbook/roles/config/tasks/check_private_ips.yml': line 8, column 3, but may\nbe elsewhere in the file depending on the exact syntax problem.\n\nThe offending line appears to be:\n\n\n- name: debug {{ target_role }}\n ^ here\nWe could be wrong, but this one looks like it might be an issue with\nmissing quotes. Always quote template expression brackets when they\nstart a value. For instance:\n\n with_items:\n - {{ foo }}\n\nShould be written as:\n\n with_items:\n - \"{{ foo }}\"\n"}
이제 다음과 같이 ansible-playbook으로 실제 설치를 수행합니다. 이 명령 하나로 3대의 서버에 모두 LSF HPC Suite가 설치되는 것입니다. 위의 test 오류에도 불구하고, 설치는 전혀 이상없이 잘 됩니다. 서버 및 네트워크 사양에 따라 다르겠지만 시간은 꽤 많이 걸립니다. 저는 1시간 정도 걸렸습니다. 아래와 같이 끝 부분에 IBM Spectrum Application Center를 열 수 있는 URL이 주어집니다. 접속해보면 실제로 잘 열립니다.
[cecuser@p628-kvm1 playbook]$ sudo ansible-playbook -i lsf-inventory lsf-deploy.yml
...
PLAY [Summary] *****************************************************************
TASK [debug] *******************************************************************
ok: [p628-kvm1 -> localhost] => {
"msg": [
"LSF Suite for HPC 10.2.0.9 deployment is done",
"Open IBM Spectrum Application Center with the following URL: http://p628-kvm1.cecc.ihost.com:8080"
]
}
PLAY RECAP *********************************************************************
localhost : ok=3 changed=0 unreachable=0 failed=0
p628-kvm1 : ok=296 changed=127 unreachable=0 failed=0
p628-kvm2 : ok=107 changed=48 unreachable=0 failed=0
p628-kvm3 : ok=107 changed=48 unreachable=0 failed=0
** 혹시 위의 설치 과정에서 뭔가 실수 등으로 잘못되어 다시 설치하고자 한다면, 그냥 다시 하면 안되고 다음과 같이 uninstall 하고 진행해야 합니다. 그러지 않을 경우 "Check if an installation was made before" 등의 error가 나면서 fail 합니다.
[cecuser@p628-kvm1 playbook]$ sudo ansible-playbook -i lsf-inventory lsf-uninstall.yml
이제 다음과 같이 lsf.conf에서 RSH이나 RCP 대신 ssh, scp를 쓰도록 설정합니다.
[cecuser@p628-kvm1 playbook]$ sudo vi /opt/ibm/lsfsuite/lsf/conf/lsf.conf
LSF_RSH=ssh
LSF_REMOTE_COPY_CMD="scp -B -o 'StrictHostKeyChecking no'"
[cecuser@p628-kvm1 ~]$ sudo ln -s /opt/ibm/lsfsuite/lsf/conf/lsf.conf /etc/lsf.conf
이제 lsfshutdown & lsfstartup을 통해 restart 합니다. 이건 root에서 해야 합니다.
[cecuser@p628-kvm1 ~]$ su -
Password:
Last login: Tue Mar 31 05:05:59 EDT 2020
-bash-4.2# . /opt/ibm/lsfsuite/lsf/conf/profile.lsf (이 profile.lsf를 수행해야 PATH 등의 환경변수가 자동설정됩니다.)
-bash-4.2# lsfshutdown
Shutting down all slave batch daemons ...
Shut down slave batch daemon on all the hosts? [y/n] y
Shut down slave batch daemon on <p628-kvm1> ...... done
Shut down slave batch daemon on <p628-kvm2.cecc.ihost.com> ...... done
Shut down slave batch daemon on <p628-kvm3.cecc.ihost.com> ...... done
Shutting down all RESes ...
Do you really want to shut down RES on all hosts? [y/n] y
Shut down RES on <p628-kvm1> ...... done
Shut down RES on <p628-kvm3.cecc.ihost.com> ...... done
Shut down RES on <p628-kvm2.cecc.ihost.com> ...... done
Shutting down all LIMs ...
Do you really want to shut down LIMs on all hosts? [y/n] y
Shut down LIM on <p628-kvm1> ...... done
Shut down LIM on <p628-kvm3.cecc.ihost.com> ...... done
Shut down LIM on <p628-kvm2.cecc.ihost.com> ...... done
-bash-4.2# lsfstartup
Starting up all LIMs ...
Do you really want to start up LIM on all hosts ? [y/n]y
Start up LIM on <p628-kvm1> ......
Starting up all RESes ...
Do you really want to start up RES on all hosts ? [y/n]y
Start up RES on <p628-kvm1> ......
Starting all slave daemons on LSBATCH hosts ...
Do you really want to start up slave batch daemon on all hosts ? [y/n] y
Start up slave batch daemon on <p628-kvm1> ......
Done starting up LSF daemons on the local LSF cluster ...
이제 다시 일반 user에서 각종 LSF 명령을 내려 봅니다.
[cecuser@p628-kvm1 ~]$ . /opt/ibm/lsfsuite/lsf/conf/profile.lsf
[cecuser@p628-kvm1 ~]$ lsid
IBM Spectrum LSF 10.1.0.9, Oct 16 2019
Suite Edition: IBM Spectrum LSF Suite for HPC 10.2.0.9
Copyright International Business Machines Corp. 1992, 2016.
US Government Users Restricted Rights - Use, duplication or disclosure restricted by GSA ADP Schedule Contract with IBM Corp.
My cluster name is myCluster
My master name is p628-kvm1
[cecuser@p628-kvm1 ~]$ lshosts
HOST_NAME type model cpuf ncpus maxmem maxswp server RESOURCES
p628-kvm1 LINUXPP POWER8 25.0 2 31.9G 3.9G Yes (mg)
p628-kvm3.c LINUXPP POWER8 25.0 2 31.9G 3.9G Yes ()
p628-kvm2.c LINUXPP POWER8 25.0 2 31.9G 3.9G Yes ()
[cecuser@p628-kvm1 ~]$ bhosts
HOST_NAME STATUS JL/U MAX NJOBS RUN SSUSP USUSP RSV
p628-kvm1 ok - 2 0 0 0 0 0
p628-kvm2.cecc.iho ok - 2 0 0 0 0 0
p628-kvm3.cecc.iho ok - 2 0 0 0 0 0
[cecuser@p628-kvm1 ~]$ bqueues
QUEUE_NAME PRIO STATUS MAX JL/U JL/P JL/H NJOBS PEND RUN SUSP
admin 50 Open:Active - - - - 0 0 0 0
owners 43 Open:Active - - - - 0 0 0 0
priority 43 Open:Active - - - - 0 0 0 0
night 40 Open:Active - - - - 0 0 0 0
short 35 Open:Active - - - - 0 0 0 0
dataq 33 Open:Active - - - - 0 0 0 0
normal 30 Open:Active - - - - 0 0 0 0
interactive 30 Open:Active - - - - 0 0 0 0
idle 20 Open:Active - - - - 0 0 0 0
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